( 1 )一九九九年十一月舉辦「臺灣天主教二次開教一百四十年學術研討會」。
( 2 )二○○一年九月與魯汶大學南懷仁文化協會合辦「第七屆中國天主教傳教史-中國教理講授史國際學術研討會」。
( 3 )二○○二年十二月,本中心承接之「中梵外交關係史研究計畫」中之子計畫,由歷史系主辦,本中心協辦,外交部補助,舉辦「中梵外交關係史國際學術研討會」。
( 4 ) 二○○四年六月十日、十一日及十四日,與香港中文大學崇基學院宗教與中國社會研究中心、香港教區聖神研究中心合辦「義和團運動與中國基督宗教國際學術研討會」。