羅光總主教擔任本校校長時，甚為重視中國天主教史相關文物資料之蒐集，乃於民國七十三年成立「中國天主教資料小組」，該小組為進口供研究使用之期刊、報紙乃擴大改為「中國天主教史料研究中心」，初由張吟秋蒙席負責，後由李振英蒙席接任。

張振東神父任輔大文學院院長時，獲得教育部特別補助及核准，成立「天主教史研究中心」，於民國八十一年元月六日由羅光總主教主持啟用典禮。設於文華樓 2 樓，由張奉箴神父任本中心主任。張奉箴神父擔任「天主教史研究中心」主任同時，亦接下「中國天主教史料研究中心」主任一職。原「中國天主教史料研究中心」研究中國大陸天主教現況之限制，隨政府之政策開放而日漸鬆綁，故兩中心之名雖存，而實際張奉箴神父推動之工作，多為有關中國天主教歷史之研究。

民國八十六年十二月三十日，張奉箴神父於參加研討會演講時，心臟病突發去世。民國八十七年八月，道明會的潘貝頎神父接任，至八十八年二月因道明會務離職。民國八十八年六月，本中心直屬之中國聖職單位決定將兩中心合併，名為「天主教史料研究中心」。八十八年九月，陳方中接任主任至九十五年七月。九十五年八月由歷史系主任雷俊玲接任主任一職迄今，中心名稱同時改為「天主教史研究中心」。